Είναι ο μικρότερος οικισμός της Δημοτικής Ενότητας Στρυμόνα με πληθυσμό 167 κατοίκους.
Οι πρώτοι κάτοικοι ήταν Θρακιώτες από το Ορτακτσί Ανατολικής Θράκης, κοντά στην Ανδριανούπολη. Εγκαταστάθηκαν το 1922 (κατά την ανταλλαγή πληθυσμών) αρχικά στην περιοχή Κάκαρα και μετά από μερικά χρόνια στο σημερινό οικισμό. Οι πρώτοι κάτοικοι έφτιαξαν καλύβες από καλάμια που έκοβαν από το βάλτο, ενώ όταν εγκαταστάθηκαν στο σημερινό οικισμό έχτισαν την εκκλησία του Αγίου Γεωργίου.
Επισήμως η Κοινότητα αναγνωρίστηκε το 1949 και προήλθε από την Κοινότητα Πεντάπολης.
Στη Μεσοκώμη έχει την έδρα της η Ένωση Νέων Αγροτών Νομού Σερρών, η οποία στεγάζεται στο ανακαινισμένο κτίριο του παλαιού Δημοτικού Σχολείου.